MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori B38 chromosome

Total Repeats: 32725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012973	CAT	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012973	T	6	6	78	83	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012973	T	6	6	129	134	0 %	100 %	0 %	0 %	254778739
4	NC_012973	TGA	3	9	215	223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778739
5	NC_012973	TG	3	6	232	237	0 %	50 %	50 %	0 %	254778739
6	NC_012973	T	6	6	353	358	0 %	100 %	0 %	0 %	254778739
7	NC_012973	AAAGCG	2	12	382	393	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	254778739
8	NC_012973	GTT	2	6	399	404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778739
9	NC_012973	T	7	7	412	418	0 %	100 %	0 %	0 %	254778739
10	NC_012973	T	7	7	440	446	0 %	100 %	0 %	0 %	254778739
11	NC_012973	TTC	2	6	450	455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778739
12	NC_012973	ACA	2	6	476	481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254778739
13	NC_012973	C	6	6	494	499	0 %	0 %	0 %	100 %	254778739
14	NC_012973	AAT	2	6	551	556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254778740
15	NC_012973	CT	3	6	609	614	0 %	50 %	0 %	50 %	254778740
16	NC_012973	C	6	6	736	741	0 %	0 %	0 %	100 %	254778740
17	NC_012973	AAC	2	6	791	796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254778740
18	NC_012973	CT	3	6	797	802	0 %	50 %	0 %	50 %	254778740
19	NC_012973	CTT	2	6	894	899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778740
20	NC_012973	TCTG	2	8	904	911	0 %	50 %	25 %	25 %	254778740
21	NC_012973	TGA	2	6	912	917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778740
22	NC_012973	TTGCAA	2	12	961	972	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	254778740
23	NC_012973	AAAT	2	8	1006	1013	75 %	25 %	0 %	0 %	254778741
24	NC_012973	AAC	2	6	1118	1123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254778741
25	NC_012973	CCG	4	12	1137	1148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254778741
26	NC_012973	CCA	2	6	1281	1286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254778741
27	NC_012973	GCT	2	6	1306	1311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254778741
28	NC_012973	CA	3	6	1320	1325	50 %	0 %	0 %	50 %	254778741
29	NC_012973	T	6	6	1337	1342	0 %	100 %	0 %	0 %	254778741
30	NC_012973	CTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778741
31	NC_012973	T	6	6	1441	1446	0 %	100 %	0 %	0 %	254778741
32	NC_012973	GGC	2	6	1497	1502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254778741
33	NC_012973	GCC	2	6	1541	1546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254778741
34	NC_012973	GCTT	2	8	1549	1556	0 %	50 %	25 %	25 %	254778741
35	NC_012973	TAAAA	2	10	1695	1704	80 %	20 %	0 %	0 %	254778741
36	NC_012973	GTT	2	6	1717	1722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778741
37	NC_012973	TAG	2	6	1740	1745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778741
38	NC_012973	CTT	2	6	1751	1756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778741
39	NC_012973	TTC	2	6	1856	1861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778742
40	NC_012973	A	7	7	1871	1877	100 %	0 %	0 %	0 %	254778742
41	NC_012973	ATTATA	2	12	1889	1900	50 %	50 %	0 %	0 %	254778742
42	NC_012973	CCTG	2	8	1904	1911	0 %	25 %	25 %	50 %	254778742
43	NC_012973	CCAA	2	8	1928	1935	50 %	0 %	0 %	50 %	254778742
44	NC_012973	TTAT	2	8	1950	1957	25 %	75 %	0 %	0 %	254778742
45	NC_012973	TGAA	2	8	1968	1975	50 %	25 %	25 %	0 %	254778742
46	NC_012973	GTT	2	6	1991	1996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778742
47	NC_012973	GC	3	6	2006	2011	0 %	0 %	50 %	50 %	254778742
48	NC_012973	T	6	6	2070	2075	0 %	100 %	0 %	0 %	254778742
49	NC_012973	CTT	2	6	2080	2085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778742
50	NC_012973	TGG	2	6	2137	2142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254778742
51	NC_012973	TCA	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778742
52	NC_012973	TAG	2	6	2251	2256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778742
53	NC_012973	G	6	6	2283	2288	0 %	0 %	100 %	0 %	254778742
54	NC_012973	ATTC	2	8	2443	2450	25 %	50 %	0 %	25 %	254778742
55	NC_012973	T	7	7	2522	2528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012973	A	8	8	2633	2640	100 %	0 %	0 %	0 %	254778743
57	NC_012973	TCTT	2	8	2649	2656	0 %	75 %	0 %	25 %	254778743
58	NC_012973	T	7	7	2729	2735	0 %	100 %	0 %	0 %	254778743
59	NC_012973	TGA	2	6	2754	2759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778743
60	NC_012973	T	7	7	2771	2777	0 %	100 %	0 %	0 %	254778743
61	NC_012973	AGC	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254778743
62	NC_012973	GC	3	6	2882	2887	0 %	0 %	50 %	50 %	254778743
63	NC_012973	A	6	6	2920	2925	100 %	0 %	0 %	0 %	254778743
64	NC_012973	AG	3	6	3039	3044	50 %	0 %	50 %	0 %	254778743
65	NC_012973	GTG	2	6	3058	3063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254778743
66	NC_012973	AGA	2	6	3156	3161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254778743
67	NC_012973	GTG	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254778743
68	NC_012973	GCC	2	6	3224	3229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254778743
69	NC_012973	AG	3	6	3319	3324	50 %	0 %	50 %	0 %	254778744
70	NC_012973	GAAA	2	8	3339	3346	75 %	0 %	25 %	0 %	254778744
71	NC_012973	GAAA	2	8	3414	3421	75 %	0 %	25 %	0 %	254778744
72	NC_012973	TG	3	6	3521	3526	0 %	50 %	50 %	0 %	254778744
73	NC_012973	GTT	2	6	3670	3675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778744
74	NC_012973	CTA	2	6	3710	3715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778744
75	NC_012973	ATC	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778744
76	NC_012973	GCGATA	2	12	3818	3829	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254778744
77	NC_012973	AGAA	2	8	3870	3877	75 %	0 %	25 %	0 %	254778744
78	NC_012973	A	6	6	3958	3963	100 %	0 %	0 %	0 %	254778744
79	NC_012973	ATT	2	6	3998	4003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254778744
80	NC_012973	GGC	2	6	4071	4076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254778744
81	NC_012973	GGT	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012973	TAT	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012973	TGG	2	6	4269	4274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012973	ATGC	2	8	4373	4380	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012973	TGG	2	6	4389	4394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012973	GTG	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012973	ACC	2	6	4536	4541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_012973	GGT	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012973	A	7	7	4670	4676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012973	T	8	8	4690	4697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012973	AAT	2	6	4711	4716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012973	TAAA	2	8	4780	4787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012973	A	6	6	4860	4865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012973	TTA	2	6	4889	4894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012973	T	7	7	4906	4912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012973	A	6	6	4917	4922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012973	A	6	6	4933	4938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012973	GTTTT	2	10	4943	4952	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012973	TGT	2	6	4972	4977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012973	TTTTA	2	10	4991	5000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012973	A	8	8	5042	5049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012973	A	7	7	5056	5062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012973	A	6	6	5073	5078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012973	TCGC	2	8	5254	5261	0 %	25 %	25 %	50 %	254778745
105	NC_012973	ATTC	2	8	5283	5290	25 %	50 %	0 %	25 %	254778745
106	NC_012973	CATT	2	8	5327	5334	25 %	50 %	0 %	25 %	254778745
107	NC_012973	ATT	2	6	5349	5354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254778745
108	NC_012973	TGG	2	6	5447	5452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254778745
109	NC_012973	A	6	6	5559	5564	100 %	0 %	0 %	0 %	254778745
110	NC_012973	TCT	2	6	5586	5591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778745
111	NC_012973	T	6	6	5591	5596	0 %	100 %	0 %	0 %	254778745
112	NC_012973	TTG	2	6	5650	5655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
113	NC_012973	TAA	2	6	5718	5723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254778745
114	NC_012973	ATT	2	6	5775	5780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254778745
115	NC_012973	GTG	2	6	5845	5850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254778745
116	NC_012973	GTT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
117	NC_012973	GC	3	6	5907	5912	0 %	0 %	50 %	50 %	254778745
118	NC_012973	CAA	2	6	5913	5918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254778745
119	NC_012973	TCA	2	6	6037	6042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254778745
120	NC_012973	T	6	6	6114	6119	0 %	100 %	0 %	0 %	254778745
121	NC_012973	GCTTGC	2	12	6148	6159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254778745
122	NC_012973	CAG	2	6	6194	6199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254778745
123	NC_012973	GTT	2	6	6246	6251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
124	NC_012973	AC	3	6	6333	6338	50 %	0 %	0 %	50 %	254778745
125	NC_012973	CTT	2	6	6440	6445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254778745
126	NC_012973	TAG	3	9	6467	6475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778745
127	NC_012973	TAG	7	21	6479	6499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254778745
128	NC_012973	TTA	2	6	6508	6513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254778745
129	NC_012973	TGT	2	6	6528	6533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
130	NC_012973	GTT	2	6	6561	6566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
131	NC_012973	TTG	2	6	6594	6599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
132	NC_012973	CGT	2	6	6614	6619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254778745
133	NC_012973	GTT	2	6	6663	6668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
134	NC_012973	TTG	2	6	6735	6740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
135	NC_012973	CCG	2	6	6797	6802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254778745
136	NC_012973	T	6	6	6845	6850	0 %	100 %	0 %	0 %	254778745
137	NC_012973	ATCG	2	8	6885	6892	25 %	25 %	25 %	25 %	254778745
138	NC_012973	GCT	2	6	6912	6917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254778745
139	NC_012973	CGTT	2	8	6920	6927	0 %	50 %	25 %	25 %	254778745
140	NC_012973	GTT	2	6	6942	6947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254778745
141	NC_012973	T	6	6	6993	6998	0 %	100 %	0 %	0 %	254778745
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